gwas分析方法优点？

一、gwas分析方法优点？

全基因组关联分析，是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异，即单核苷酸多态性（SNP），从中筛选出与疾病相关的SNPs。

GWAS为人们打开了一扇通往研究复杂疾病的大门，将在患者全基因组范围内检测出的SNP位点与对照组进行比较，找出所有的变异等位基因频率，从而避免了像候选基因策略一样需要预先假设致病基因。GWAS一般采用非假说驱动。由于GWAS研究的各种研究设计方法以及遗传统计方法无法从根本上消除人群混杂、多重比较造成的假阳性，我们需要通过重复研究来保证遗传标记与疾病间的真关联。

二、gwas分析原理及流程？

名词解释和基本问题：

关联分析：就是AS的中文，全称是GWAS。应用基因组中数以百万计的单核苷酸多态；SNP为分子遗传标记，进行全基因组水平上的对照分析或相关性分析，通过比较发现影响复杂性状的基因变异的一种新策略。在全基因组范围内选择遗传变异进行基因分析，比较异常和对照组之间每个遗传变异及其频率的差异，统计分析每个变异与目标性状之间的关联性大小，选出最相关的遗传变异进行验证，并根据验证结果最终确认其与目标性状之间的相关性。

连锁不平衡：LD，P(AB)= P(A)*P(B)。不连锁就独立，如果不存在连锁不平衡——相互独立，随机组合，实际观察到的群体中单倍体基因型 A和B 同时出现的概率。P (AB) = D + P (A) * P (B) 。D是表示两位点间LD程度值。

曼哈顿图：在生物和统计学上，做频率统计、突变分布、GWAS关联分析的时候，我们经常会看到一些非常漂亮的manhattan plot，能够对候选位点的分布和数值一目了然。位点坐标和pvalue。map文件至少包含三列——染色体号，SNP名字，SNP物理位置。assoc文件包含SNP名字和pvalue。haploview即可画出。

SNP的本质属性是什么？广义上讲是变异：most common type of genetic variation，平级的还有indel、CNV、SV。Each SNP represents a difference in a single DNA building block, called a nucleotide. 狭义上讲是标记：biological markers，因为SNP是单碱基的，所以SNP又是一个位点，标记了染色体上的一个位置。大部分人的基因组，99%都是一模一样的，还有些SNP的位点，就是一些可变的位点，在人群中有差异。这些差异/标记可以用于疾病的分析，根据统计学原理，找出与疾病最相关的位点，从而确定某个疾病的risk allele。

三、php数据分析是前端吗？

php数据分析不是前端。

因为php数据分析一般指的是用php编写的数据分析的框架的，这种是属于后端的，本身php开发编程语言就是属于后端编程开发语言的一种的，针对的是服务器方面的研究的，所以他是属于后端而不是前端的，前端一般针对的是js语言的开发。

四、如何确认gwas中的SNP哪些是tagSNP？

功能snp一般指对相应基因表达蛋白活性或表达量有明显影响，从而有明确功能影响的snp，比如cyp2c19的*2、*3多态性的snp可以降低相应酶活性造成慢代谢。

五、PHP的算法可以实现大数据分析吗？

首先，算法和语言无关；

其次，php的优势在于web开发，其它方面也可以应用，但并不主流；

大数据处理java、python之类更好些，任何方面的应用最重要的其实是生态系统是否完善。

六、怎么将脚本编译后运行？-PHP内核源码分析？

1，嵌入到页面中2，使用cscript.exe执行3，hta也可以最简单的方法是用浏览器，通过html的onload事件去调用，当然也可以用其他方法。js是解释型语言不用编译。

七、php是什么？php的基本介绍？

PHP原始为Personal Home Page的缩写，现已正式更名为Hypertext Preprocesso，中文名称为超文本预处理器。

是一种通用开源脚本语言，PHP是在服务器端执行的脚本语言，主要适用于Web开发领域，随着移动应用的兴起，PHP也可用于开发API接口。

八、如何学好PHP？PHP该怎么去学？

说一说我个人的学习历程吧，可以当做参考。

首先，我是买了一本PHP零基础的书籍，结合着一本HTML的书籍开始学习的，按照书籍上的操作，把代码都敲了一遍，当时确实只能大概熟悉一下，其实真正了解还是需要之后的回顾才能真正掌握。

其次，就是要多问，尤其是刚开始学习的时候，好多问题一时间根本搞不懂，需要多问身边的高手，或者通过其它渠道方式多交流问题，记得解决后做好总结。

最后，就是要做到成长，扩展，要知道不能只局限于PHP，比如HTML,JS,Linux,MySQL,服务器配置等很多相关的知识要同步掌握，这样才会逐渐掌握PHP工程师日常要涉及到的工作。

九、.php文件的开头是php吗？

PHP文件名以php为后缀。PHP代码以“<?php”开头，以“?>”结束，中间为php代码，代码行都必须以分号结束。

十、php中add.php的作用？

add.php 的作用是用于将用户输入的数据添加到数据库中。它可以在前端页面的表单中获取用户输入的数据，并将这些数据传递到后端的 add.php 文件中，通过服务器端脚本语言 PHP 处理和验证数据的合法性，然后将数据存储到相应的数据库表中。

通过 add.php，我们可以方便地实现数据的添加、修改和删除等操作，使网站的数据操作功能更加完善和易用。同时，可以通过添加一些安全机制，确保前端传递的数据的安全性和可靠性。

顶一下

(0)

0%

踩一下

(0)

0%